Сергей Григорьевич Перников родился в 1968 году в Ленинграде.

В 1994 году окончил юридический факультет Санкт-Петербургского государственного университета (СПГУ) по специальности «юриспруденция».

В 2007 году окончил экономический факультет СПГУ по специальности «экономика и управление предприятием».

В 1986 — 1989 году проходил службу в пограничных войсках Военно-морского флота. Работал юрисконсультом на заводе «Русский Дизель», заместителем начальника юридического управления «Банка «Санкт-Петербург», советником по правовым вопросам в Банке «Кредит-Петербург» и «Лэнд Банк».

С 1995 года – адвокат; а с 1997 года - заведующий юридической консультации №26 г. Санкт-Петербурга, специализирующейся на вопросах инвестиционной, внешнеэкономической и банковской деятельности.

С 1999 по 2008 год являлся членом Совета Директоров «Промышленной группы «Содружество «Северо-Запад», курировавшим вопросы деятельности ряда промышленных и сельскохозяйственных предприятий, в т.ч. ООО «Топливные системы», ООО «Русско-Высоцкая птицефабрика», ООО «Свинокомплекс «Восточный» .

Также до последнего времени входил в состав Совета директоров «Холдинговой Компании «ЛЕНИНЕЦ».

Является консультантом-экспертом департамента социально-экономического и финансового мониторинга аппарата полномочного представителя Президента РФ в Северо-Западном федеральном округе и членом рабочей группы по торгово-экономическому сотрудничеству с провинциями КНР при аппарате полпреда в СЗФО.

2 марта 2009 года губернатором Псковской области Андреем Турчаком Сергей Перников назначен и.о. первого заместителя губернатора.

С 2013 по 2018 год - заместитель губернатора Псковской области. Курировал вопросы, связанные с инвестиционным развитием региона и увеличением доходной части областного бюджета, комитет по природопользованию и охране окружающей среды, работу представительств администрации Псковской области при Правительстве России и в Великих Луках.